にんじんの色が薄いのは栄養が少ないような気がしますが

にんじんの色の違いはおもに品種によるものです。

栄養成分の含有量は、品種、産地、土壌、天候、生産方法などによって差が出ます。
にんじんの色はにんじんのカロテン(ビタミンA)の含有量によりますので、ビタミンAの含有量は差がある可能性もあります。

金時ニンジンと西洋人参(普通の人参)では下記のよう、に少しですが栄養成分に差が出ます。

「五訂増補 日本食品標準成分表」

含有量(100g当たり)… にんじん / きんとき

エネルギー ……………… 37 kcal / 44 kcal
水分 ……………………… 89.5 g / 87.3 g
たんぱく質 ……………… 0.6 g / 1.8 g
脂質 ……………………… 0.1 g / 0.2 g
炭水化物 ………………… 9.1 g / 9.6 g
灰分 ……………………… 0.7 g / 1.1 g

(ミネラル)
ナトリウム ……………… 24 mg / 11 mg
カリウム ………………… 280 mg / 540 mg
カルシウム ……………… 28 mg / 37 mg
マグネシウム …………… 10 mg / 11 mg
リン ……………………… 25 mg / 64 mg
鉄 ………………………… 0.2 mg / 0.4 mg
亜鉛 ……………………… 0.2 mg / 0.9 mg
銅 ………………………… 0.04 mg / 0.09 mg
マンガン ………………… 0.10 mg / 0.15 mg

(ビタミン)
レチノール ……………… 0 μg / 0 μg
α-カロテン …………… 2800 μg / 250 μg
β-カロテン …………… 7700 μg / 4800 μg
クリプトキサンチン …… 0 μg / 0 μg
β-カロテン当量 ……… 9100 μg / 5000 μg
レチノール当量 ………… 760 μg / 410 μg
ビタミンD ……………… 0 μg / 0 μg
α-トコフェロール …… 0.5 mg / 0.5 mg
β-トコフェロール …… Tr mg / 0 mg
γ-トコフェロール …… 0 mg / 0 mg
δ-トコフェロール …… 0 mg / 0 mg
ビタミンK ……………… 3 μg / 2 μg
ビタミンB1 …………… 0.05 mg / 0.07 mg
ビタミンB2 …………… 0.04 mg / 0.05 mg
ナイアシン ……………… 0.70 mg / 1.00 mg
ビタミンB6 …………… 0.11 mg / 0.12 mg
ビタミンB12 ………… 0 μg / 0 μg
葉酸 ……………………… 28 μg / 110 μg
パントテン酸 …………… 0.40 mg / 0.32 mg
ビタミンC ……………… 4 mg / 8 mg

(その他)
飽和脂肪酸 ……………… 0.01 g / 0.01 g
一価不飽和脂肪酸 ……… Tr g / Tr g
多価不飽和脂肪酸 ……… 0.03 g / 0.04 g
脂肪酸総量 ……………… 0.04 g / 0.05 g
水溶性食物繊維 ………… 0.7 g / 1.5 g
不溶性食物繊維 ………… 2.0 g / 2.4 g
食物繊維総量 …………… 2.7 g / 3.9 g